長崎県
| 指定 | 建造物名称 | 所在地 | 竣工年 | 設計者 |
| 国宝 | 崇福寺 大雄宝殿 | 長崎市鍛冶屋町 | 江戸時代・正保３年（１６４６） | |
| 国宝 | 〃 第一峰門 | 〃 | 江戸時代・寛永２１年（１６４４） | |
| 重文 | 〃 護法堂 | 〃 | 江戸時代・享保１６年（１７３１） | |
| 重文 | 〃 鐘鼓楼 | 〃 | 江戸時代・享保１３年（１７２８） | |
| 重文 | 〃 三門（楼門） | 〃 | 江戸時代・嘉永２年（１８４９） | |
| 〃 媽姐堂 | 〃 | 江戸時代・寛政６年（１７６４） | ||
| 重文 | 〃 媽姐門 | 〃 | 江戸時代・安政１０年（１８２７） | |
| 重文 | 清水寺本堂 | 〃 | 江戸時代・寛文８年（１６６８） | |
| 聖福寺 大雄宝殿 | 長崎市玉園町 | 江戸時代・元禄１０年（１６９７） | ||
| 〃 天王殿 | 〃 | 江戸時代・宝永２年（１７０５） | ||
| 〃 鐘楼 | 〃 | 江戸時代・享保元年（１７１６） | ||
| 〃 山門 | 〃 | 江戸時代・元禄１６年（１７０３） | ||
| 〃 惜字亭 | 〃 | 江戸時代・慶応２年（１８６６） | ||
| 重文 | 興福寺 大雄宝殿 | 長崎市寺町 | 明治１６年（１８８３） | |
| 〃 山門 | 〃 | 江戸時代・元禄４年（１６９１） | ||
| 〃 三江会所門 | 〃 | 明治１６年（１８８３） | ||
| 〃 媽姐堂 | 〃 | 江戸時代・宝永３年（１７０６） | ||
| 〃 中島聖堂大学門 | 〃 | 江戸時代・末期 | ||
| 〃 鼓楼 | 〃 | 江戸時代・享保１５年（１７３０） | ||
| 重文 | 旧唐人屋敷門 | 〃 | 江戸時代・中期 | |
| 活水女学院 本館 | 長崎市東山手町 | 大正１５年（１９２６） | ヴォーゲル | |
| 〃 同窓会館 | 〃 | 明治後期 | ||
| 海星学園中央館 | 〃 | 昭和３４年（１９５９） | 吉阪隆正 | |
| 北大浦小学校 | 長崎市東山町 | 昭和２年（１９２７） | ||
| 国宝 | 大浦天主堂 | 長崎市南山手町 | 江戸時代・元治元年（１８６４） | プチジャン神父 |
| 重文 | 旧羅典神学校 | 〃 | 明治８年（１８７５） | ド・ロ神父 |
| 重文 | 旧グラバー住宅 | 〃 | 江戸時代・文久３年（１８６３） | |
| 重文 | 旧リンガー住宅 | 〃 | 明治元年（１８６８） | |
| 重文 | 旧オルト住宅 | 〃 | 江戸時代・慶応元年（１８６５） | |
| 親和銀行大波止支店 | 長崎市五島町 | 昭和３８年（１９６３） | 白井晟一 | |
| 長崎市科学館 | 長崎市油木町 | 平成８年（１９９６） | 仙田満 | |
| 長崎県立総合体育館 | 〃 | 平成６年（１９９４） | 日本設計 | |
| 花みずきレディースクリニック | 長崎市住吉町 | 平成１５年（２００３） | 伊藤恭行 | |
| 長崎大学経済学部瓊林館 | 長崎市片淵 | 大正９年（１９２０） | ||
| 長崎県美術館 | 長崎市出島町 | 平成１７年（２００５） | 隈研吾 | |
| 旧出島神学校 | 〃 | 明治１０年（１８７７） | ||
| 出島内外倶楽部 | 〃 | 明治３０年（１８９７） | ||
| 出島橋 | 〃 | 明治４３年（１９１０） | ||
| 旧日本生命長崎支店 | 〃 | 昭和２年（１９２７） | ||
| 長崎市公会堂 | 長崎市魚の町 | 昭和３７年（１９６２） | 武基雄 | |
| 江崎べっ甲店 | 〃 | 明治３１年（１８９８） | ||
| 日本二十六聖人殉教記念館 | 長崎市西坂町 | 昭和３７年（１９６２） | 今井兼次 | |
| 長崎原爆死没者追悼平和祈念館 | 長崎市平野町 | 平成１５年（２００３） | 栗生明 | |
| 長崎原爆資料館 | 〃 | 平成８年（１９９６） | 久米設計 | |
| 長崎市平和会館 | 〃 | 昭和５６年（１９８１） | 梓設計 | |
| 山王神社二の鳥居 | 長崎市坂本 | 大正１３年（１９２４） | ||
| 旧市立高等女学校 | 長崎市下西山町 | 大正１２年（１９２３） | ||
| 諏訪荘 | 長崎市上西山町 | 明治４３年（１９１０） | 野口久太郎 | |
| ナガサキピースミュージアム | 長崎市松ヶ枝町 | 平成１５年（２００３） | 古市徹雄 | |
| 長崎港上屋Ｂ棟 | 長崎市元船町 | 平成６年（１９９４） | 北川原温 | |
| 長崎港上屋Ｃ棟 | 〃 | 平成１０年（１９９８） | マリケル・ロトンディ | |
| 長崎港旅客ターミナル | 〃 | 平成７年（１９９５） | 高松伸 | |
| 江上耳鼻咽喉科クリニック | 長崎市中園町 | 昭和５７年（１９８２） | 葉祥栄 | |
| 宝製鋼 | 長崎市小曽根町 | 明治３５年（１９０２） | ウォーカー | |
| 長崎銀行本店 | 長崎市栄町 | 大正１３年（１９２４） | 末広平作 | |
| 旧長崎警察署庁舎 | 長崎市江戸町 | 大正１２年（１９２３） | ||
| 文明堂総本店 | 〃 | 昭和２７年（１９５２） | ||
| 重文 | 眼鏡橋 | 長崎市古川町 | 江戸時代・寛永１１年（１６３４） | |
| 重文 | 旧長崎英国領事館 本館 | 長崎市大浦町 | 明治４０年（１９０７） | コーワン |
| 重文 | 〃 付属屋 | 〃 | 明治４０年（１９０７） | コーワン |
| 重文 | 〃 職員住宅 | 〃 | 明治４０年（１９０７） | コーワン |
| 重文 | 旧長崎税関下り松派出所 | 長崎市松が枝町 | 明治３１年（１８９８） | |
| 重文 | 旧香港上海銀行長崎支店 | 〃 | 明治３７年（１９０４） | 下田菊太郎 |
| 親和銀行本店 第１期 | 佐世保市島瀬町 | 昭和４２年（１９６７） | 白井晟一 | |
| 〃 第２期 | 〃 | 昭和４４年（１９６９） | 白井晟一 | |
| 〃 第３期・懐霄館 | 〃 | 昭和５０年（１９７５） | 白井晟一 | |
| 佐世保市博物館 | 〃 | 昭和５８年（１９８３） | 岡野真一 | |
| 佐世保新みなとターミナル | 佐世保市新港町 | 平成１５年（２００３） | 北川原温 | |
| 三浦町カトリック教会堂 | 佐世保市三浦町 | 昭和６年（１９３１） | ||
| 聖心幼稚園 | 〃 | 昭和６年（１９３１） | 鉄川与助 | |
| 九品寺本堂 | 佐世保市谷郷町 | 平成１２年（２０００） | 古市徹雄 | |
| 旧佐世保海軍凱旋記念館 | 佐世保市平瀬町 | 大正１２年（１９２３） | ||
| 重文 | 諫早眼鏡橋 | 諫早市高城町 | 江戸時代・天保１３年（１８３９） | |
| 旧長崎刑務所 | 諫早市原口町 | 明治４０年（１９０７） | 山下啓次郎 | |
| 諫早市民センター | 諫早市東小路町 | 昭和４７年（１９７２） | 武基雄 | |
| 十八銀行諫早支店 | 諫早市本町 | 昭和６年（１９３１） | 清水組 |